医疗
最著名的生物医疗红外应用就是在机场的发热人员探测。长波红外相机对于温度的探测能力可以帮助减低传染疾病的传播。
在制药行业，短波红外相机经常应用在高光谱成像系统。根据药物化合物在短波红外波段的光谱特征进行检查。
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生物和化学分析
在生物医疗应用当中，短波红外荧光技术可以对人体内部组织进行成像，这项技术可以在癌症研究中提供一种高分辨率的成像手段，分辨率可以在几个毫米以下。光学激发后，有机染料、荧光蛋白或量子点的荧光在生物组织的低损耗窗口中可检测。
牙科红外成像
短波红外相机在OCT(光学断层相干扫描)仪器上可以用在牙科领域，例如通过在早期阶段扫描牙齿和牙龈，能够更早的发现龋齿。
药品红外成像
短波红外相机搭建的高光谱成像系统在制药应用当中得到广泛的应用。例如可以用光谱相机检查外形类似的通用药片：阿司匹林，乙酰氨基酚，维生素C和维生素D。基于它们在短波红外谱段不同的光谱特性，某段光谱是否存在以及光谱响应的一致性能够探测出不同的药物成分。这种技术能够对药物进行质量控制，并且能够识别假药。
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碳纳米管的应用和基于发光的成像技术